Выставляйте клиенту на каждый платёж по графику отдельный счет. Потом отслеживайте дебиторскую задолженность в вкладке счета.

На тарифе "Команда" с использованием дополнительных инструментов можно организовать постоянное информирование клиентов о своевременном внесении платежа, давать ссылку на онлайн оплату